(1)沼气微生物自身耗能少 沼气发酵过程中，沼气微生物获得自身生长繁殖需要的能量少。在有机物质(基质)相同的条件下，厌氧消化所释放的能量仅为耗氧消化所释放能量的1／30～1／20。由于获得能量少，所以沼气微生物自身生长繁殖较慢，生成的污泥量也较少，对于基质来说，则有大约90％的COD(化学需氧量)被转换成沼气。由于沼气微生物的生长缓慢，因而减少了基质的分解速度，基质的滞留时间也就较长，所以需要较大的发酵容器。
    (2)沼气发酵能够处理高浓度的有机废物 好氧条件下，一般只能处理COD含量在1 000mg／L以下的有机废水，而沼气发酵处理的废水COD含量可以高达10 000mg／L以上。
    (3)能处理的废物种类多 COD即化学需氧量，表示用化学方法使有机物彻底氧化时所消耗氧的数量，单位是g·kg-1。在试验或环境监测中，常以它来表示废水中有机物浓度，单位是mg／L。 除了人、畜粪便，各种农作物的有机废物外，各厂废物，如豆制品厂废水、合成脂肪酸废水等都可用来进行沼气发酵。但沼气发酵只能去除90％以下的有机物，要达到国家排放标准，沼气发酵处理后的废液仍需再进行好氧处理。
    (4)沼气发酵受温度影响较大 沼气发酵受温度影响大。温度高，则处理能力强，即沼气产气率高。实际上，对不同发酵温度，有其相适应的菌群。一般分为高温(50～60℃)、中温(30～35℃)和常温(自然温度)三种。高温发酵处理能力最强，中温次之，但这两类发酵都需要输入一定的热能来维持其所需的恒定发酵温度。

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